SRAをFASTQに変換

NCBI SRA からダウンロードした.sraを.fastqにする。

SRA Toolkitを使う（たとえば、ver 2.1.9）

必要なデータ

　<in.sra>

コマンド

　fastq-dump.2.1.9 <in.sra>

作られるデータ

　<in.sra>と同じprefixの.fastq（in.fastq）

paired-endのfastqがセットになった.sraの場合、

fastq-dump.2.1.9 に 「--split-3」を与える

コマンド

　fastq-dump.2.1.9 --split-3 <in.sra>

作られるデータ

　in_1.fastqとin_2.fastq

SRAをFASTQに変換できない？
そう困ったときは、paired-endかもしれないと疑ってみるのがいいみたい。